La flamme olympique allumée le 12 mars à Olympie avait déjà connu une modification de parcours avant le report des Jeux. Le relais en Grèce avait été écourté, et la cérémonie de passation s’était déroulée à huis-clos.
Au Japon, des mesures visant à protéger les relayeurs ont été mises en place et les festivités devant accompagner la flamme ont été annulées. Il s’agissait de préserver la tradition Olympique tout en évitant la propagation du coronavirus dans les pays concernés.
La flamme Olympique devait d’abord être exposée dans les régions les plus sinistrées par la catastrophe du 11 mars 2011 pour y symboliser l’effort de revitalisation. Le tremblement de terre puis le tsunami avaient ravagé la région de Tohoku, et notamment la préfecture de Miyagi qui a accueilli l’arrivée de la flamme, celle de Fukushima, point de départ du relais et la préfecture d’Iwate.